MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei 1026b chromosome 2

Total Repeats: 85552

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017832	CGA	2	6	9	14	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863736
2	NC_017832	ATCC	2	8	24	31	25 %	25 %	0 %	50 %	386863736
3	NC_017832	GAA	2	6	34	39	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386863736
4	NC_017832	TGCGC	2	10	45	54	0 %	20 %	40 %	40 %	386863736
5	NC_017832	TTC	2	6	106	111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386863736
6	NC_017832	GCGA	2	8	169	176	25 %	0 %	50 %	25 %	386863736
7	NC_017832	GGC	2	6	243	248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386863736
8	NC_017832	GAA	2	6	265	270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386863736
9	NC_017832	GC	3	6	278	283	0 %	0 %	50 %	50 %	386863736
10	NC_017832	GC	3	6	290	295	0 %	0 %	50 %	50 %	386863736
11	NC_017832	GAA	2	6	301	306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386863736
12	NC_017832	GCA	2	6	345	350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863736
13	NC_017832	AGC	2	6	355	360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863736
14	NC_017832	GGC	3	9	366	374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386863736
15	NC_017832	CG	4	8	441	448	0 %	0 %	50 %	50 %	386863736
16	NC_017832	GCC	2	6	464	469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386863736
17	NC_017832	GAAAAT	2	12	556	567	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386863736
18	NC_017832	GCT	2	6	570	575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386863736
19	NC_017832	CGC	2	6	609	614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386863736
20	NC_017832	GCA	2	6	675	680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863736
21	NC_017832	GCG	2	6	708	713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386863736
22	NC_017832	TCG	2	6	728	733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386863736
23	NC_017832	GCA	2	6	749	754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863736
24	NC_017832	CAA	2	6	814	819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386863736
25	NC_017832	GC	4	8	835	842	0 %	0 %	50 %	50 %	386863736
26	NC_017832	AGCC	2	8	918	925	25 %	0 %	25 %	50 %	386863736
27	NC_017832	CGC	2	6	945	950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386863736
28	NC_017832	CGC	2	6	987	992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386863736
29	NC_017832	GCG	2	6	1058	1063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386863736
30	NC_017832	ACG	2	6	1085	1090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863736
31	NC_017832	GCC	4	12	1156	1167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386863736
32	NC_017832	ACA	2	6	1180	1185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386863736
33	NC_017832	TGGCT	2	10	1289	1298	0 %	40 %	40 %	20 %	386863737
34	NC_017832	TTC	2	6	1364	1369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386863737
35	NC_017832	CGA	2	6	1390	1395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863737
36	NC_017832	GTGCG	2	10	1500	1509	0 %	20 %	60 %	20 %	386863737
37	NC_017832	CGA	2	6	1533	1538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863737
38	NC_017832	CG	3	6	1549	1554	0 %	0 %	50 %	50 %	386863737
39	NC_017832	TCG	2	6	1560	1565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386863737
40	NC_017832	GCC	2	6	1578	1583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386863737
41	NC_017832	ACG	2	6	1671	1676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863737
42	NC_017832	CG	3	6	1689	1694	0 %	0 %	50 %	50 %	386863737
43	NC_017832	GCC	2	6	1709	1714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386863737
44	NC_017832	CCG	3	9	1787	1795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386863737
45	NC_017832	GC	3	6	1812	1817	0 %	0 %	50 %	50 %	386863737
46	NC_017832	TTCC	2	8	1828	1835	0 %	50 %	0 %	50 %	386863737
47	NC_017832	GCGCC	2	10	1839	1848	0 %	0 %	40 %	60 %	386863737
48	NC_017832	GCG	2	6	1886	1891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386863737
49	NC_017832	TCG	2	6	1914	1919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386863737
50	NC_017832	CG	4	8	1929	1936	0 %	0 %	50 %	50 %	386863737
51	NC_017832	TCG	2	6	1983	1988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386863737
52	NC_017832	TCT	2	6	2058	2063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386863737
53	NC_017832	CGA	2	6	2079	2084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863737
54	NC_017832	AGCC	2	8	2138	2145	25 %	0 %	25 %	50 %	386863737
55	NC_017832	GC	3	6	2163	2168	0 %	0 %	50 %	50 %	386863737
56	NC_017832	GAC	2	6	2183	2188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863737
57	NC_017832	GCCA	2	8	2207	2214	25 %	0 %	25 %	50 %	386863737
58	NC_017832	GCG	2	6	2289	2294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386863737
59	NC_017832	GC	3	6	2501	2506	0 %	0 %	50 %	50 %	386863738
60	NC_017832	CGGCA	2	10	2527	2536	20 %	0 %	40 %	40 %	386863738
61	NC_017832	GC	4	8	2546	2553	0 %	0 %	50 %	50 %	386863738
62	NC_017832	CGA	2	6	2625	2630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863738
63	NC_017832	TCG	2	6	2633	2638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386863738
64	NC_017832	GCCTCG	2	12	2726	2737	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386863738
65	NC_017832	GCA	2	6	2745	2750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863738
66	NC_017832	GCC	2	6	2751	2756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386863738
67	NC_017832	GC	3	6	3029	3034	0 %	0 %	50 %	50 %	386863739
68	NC_017832	CGCC	2	8	3040	3047	0 %	0 %	25 %	75 %	386863739
69	NC_017832	GCC	2	6	3052	3057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386863739
70	NC_017832	CGC	2	6	3068	3073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386863739
71	NC_017832	GC	3	6	3145	3150	0 %	0 %	50 %	50 %	386863739
72	NC_017832	TCG	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386863739
73	NC_017832	GCC	2	6	3343	3348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386863739
74	NC_017832	TCG	2	6	3361	3366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386863739
75	NC_017832	CGG	2	6	3415	3420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386863739
76	NC_017832	CG	3	6	3421	3426	0 %	0 %	50 %	50 %	386863739
77	NC_017832	TCG	2	6	3432	3437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386863739
78	NC_017832	CGG	2	6	3488	3493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386863739
79	NC_017832	GGT	2	6	3524	3529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386863739
80	NC_017832	CG	3	6	3534	3539	0 %	0 %	50 %	50 %	386863739
81	NC_017832	CG	3	6	3772	3777	0 %	0 %	50 %	50 %	386863740
82	NC_017832	GGC	2	6	3819	3824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386863740
83	NC_017832	CGG	2	6	3840	3845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386863740
84	NC_017832	CACG	2	8	3846	3853	25 %	0 %	25 %	50 %	386863740
85	NC_017832	AAC	2	6	3871	3876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386863740
86	NC_017832	CGC	3	9	3909	3917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386863740
87	NC_017832	GGC	2	6	3921	3926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386863740
88	NC_017832	AGC	2	6	3992	3997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863740
89	NC_017832	CGA	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863740
90	NC_017832	GCT	2	6	4052	4057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386863740
91	NC_017832	CGG	2	6	4068	4073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386863740
92	NC_017832	GCT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386863740
93	NC_017832	CGA	2	6	4092	4097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863740
94	NC_017832	ACG	2	6	4100	4105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863740
95	NC_017832	ATC	2	6	4108	4113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386863740
96	NC_017832	CGA	2	6	4116	4121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863740
97	NC_017832	CAT	2	6	4137	4142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386863740
98	NC_017832	AAC	2	6	4186	4191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386863740
99	NC_017832	CGG	2	6	4232	4237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386863740
100	NC_017832	GC	4	8	4238	4245	0 %	0 %	50 %	50 %	386863740
101	NC_017832	CGAC	2	8	4259	4266	25 %	0 %	25 %	50 %	386863740
102	NC_017832	CAT	2	6	4287	4292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386863740
103	NC_017832	GC	3	6	4334	4339	0 %	0 %	50 %	50 %	386863740
104	NC_017832	CGA	2	6	4350	4355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863740
105	NC_017832	GCG	2	6	4409	4414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386863740
106	NC_017832	GCG	2	6	4463	4468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386863740
107	NC_017832	CG	3	6	4488	4493	0 %	0 %	50 %	50 %	386863740
108	NC_017832	TCG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386863740
109	NC_017832	GCT	2	6	4509	4514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386863740
110	NC_017832	CGA	2	6	4605	4610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863740
111	NC_017832	GC	4	8	4613	4620	0 %	0 %	50 %	50 %	386863740
112	NC_017832	GC	3	6	4635	4640	0 %	0 %	50 %	50 %	386863740
113	NC_017832	GC	3	6	4646	4651	0 %	0 %	50 %	50 %	386863740
114	NC_017832	GCG	2	6	4672	4677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386863740
115	NC_017832	GCT	2	6	4761	4766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386863740
116	NC_017832	CG	3	6	4811	4816	0 %	0 %	50 %	50 %	386863740
117	NC_017832	CG	4	8	4819	4826	0 %	0 %	50 %	50 %	386863740
118	NC_017832	CGCA	2	8	4831	4838	25 %	0 %	25 %	50 %	386863740
119	NC_017832	CG	3	6	4856	4861	0 %	0 %	50 %	50 %	386863740
120	NC_017832	GATC	2	8	4866	4873	25 %	25 %	25 %	25 %	386863740
121	NC_017832	CGGGC	2	10	4962	4971	0 %	0 %	60 %	40 %	386863741
122	NC_017832	ACG	2	6	5012	5017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863741
123	NC_017832	TCA	2	6	5021	5026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386863741
124	NC_017832	CCG	2	6	5031	5036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386863741
125	NC_017832	GAC	2	6	5077	5082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863741
126	NC_017832	AGA	2	6	5090	5095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386863741
127	NC_017832	TCG	2	6	5141	5146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386863741
128	NC_017832	CG	3	6	5233	5238	0 %	0 %	50 %	50 %	386863741
129	NC_017832	GCG	2	6	5241	5246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386863741
130	NC_017832	CGA	2	6	5355	5360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863741
131	NC_017832	CGC	2	6	5364	5369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386863741
132	NC_017832	TCG	2	6	5420	5425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386863741
133	NC_017832	GC	4	8	5495	5502	0 %	0 %	50 %	50 %	386863741
134	NC_017832	CGT	2	6	5505	5510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386863741
135	NC_017832	CG	3	6	5544	5549	0 %	0 %	50 %	50 %	386863741
136	NC_017832	CG	3	6	5566	5571	0 %	0 %	50 %	50 %	386863741
137	NC_017832	CG	3	6	5582	5587	0 %	0 %	50 %	50 %	386863741
138	NC_017832	GCT	2	6	5679	5684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386863741
139	NC_017832	CGG	2	6	5700	5705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386863741
140	NC_017832	GCT	2	6	5715	5720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386863741
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153	NC_017832	CGC	2	6	6695	6700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386863742
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158	NC_017832	CGG	2	6	6845	6850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386863742
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171	NC_017832	TCG	2	6	7275	7280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386863743
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239	NC_017832	CG	3	6	9855	9860	0 %	0 %	50 %	50 %	386863746
240	NC_017832	CGA	2	6	9897	9902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863746
241	NC_017832	CG	5	10	9918	9927	0 %	0 %	50 %	50 %	386863746
242	NC_017832	CAT	2	6	9955	9960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386863746
243	NC_017832	ATC	2	6	9974	9979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386863746
244	NC_017832	CGACG	2	10	10147	10156	20 %	0 %	40 %	40 %	386863746
245	NC_017832	ACG	3	9	10154	10162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863746
246	NC_017832	TGC	2	6	10211	10216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386863746
247	NC_017832	CGG	2	6	10254	10259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386863746
248	NC_017832	CG	4	8	10260	10267	0 %	0 %	50 %	50 %	386863746
249	NC_017832	CAC	2	6	10271	10276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386863746
250	NC_017832	TCG	2	6	10305	10310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386863746
251	NC_017832	GCG	2	6	10330	10335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386863746
252	NC_017832	GTGCC	2	10	10373	10382	0 %	20 %	40 %	40 %	386863746
253	NC_017832	CTG	2	6	10396	10401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386863746
254	NC_017832	GAC	2	6	10402	10407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863746
255	NC_017832	GCC	2	6	10438	10443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386863746
256	NC_017832	CGCC	2	8	10497	10504	0 %	0 %	25 %	75 %	386863746
257	NC_017832	CGGC	2	8	10508	10515	0 %	0 %	50 %	50 %	386863746
258	NC_017832	GCACG	2	10	10522	10531	20 %	0 %	40 %	40 %	386863746
259	NC_017832	GC	3	6	10543	10548	0 %	0 %	50 %	50 %	386863746
260	NC_017832	CGG	2	6	10580	10585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386863746
261	NC_017832	CAG	2	6	10654	10659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863746
262	NC_017832	GTC	2	6	10690	10695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386863746
263	NC_017832	CAT	2	6	10699	10704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386863746
264	NC_017832	GCG	2	6	10774	10779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386863746
265	NC_017832	GC	4	8	10794	10801	0 %	0 %	50 %	50 %	386863746
266	NC_017832	CG	5	10	10904	10913	0 %	0 %	50 %	50 %	386863746
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291	NC_017832	ATC	2	6	11639	11644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386863747
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381	NC_017832	GC	3	6	16007	16012	0 %	0 %	50 %	50 %	386863752
382	NC_017832	CGC	3	9	16010	16018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386863752
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385	NC_017832	CCG	2	6	16115	16120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386863752
386	NC_017832	GC	3	6	16147	16152	0 %	0 %	50 %	50 %	386863752
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390	NC_017832	CAC	2	6	16304	16309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386863753
391	NC_017832	CTC	2	6	16310	16315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386863753
392	NC_017832	CGA	2	6	16360	16365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386863753
393	NC_017832	GCG	2	6	16366	16371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386863753
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472	NC_017832	CCG	2	6	20239	20244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386863757
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